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Perché la modellazione della medicina è distribuita sui computer delle persone normali?

Ci sono alcuni progetti informatici distribuiti su Internet che cercano di trovare una cura per le malattie, come World Community Grid . Qualcuno può dire perché esistono queste cose e quanto sono utili? Voglio dire, credo che se sei un ricercatore serio, credo che tu sia in grado di usare le reti dell'università o i supercomputer per fare modellazione. Allora, qual è l'idea di diffondere la modellazione ai normali computer? La modellazione medica richiede così tanta potenza di calcolo che i computer delle università non hanno abbastanza potenza di calcolo?
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2018-11-07 11:22:05 +0000

Non so quanto siano facilmente disponibili i supercomputer per i ricercatori e le università, ma immagino che gran parte della risposta alla sua domanda sia dovuta ai costi.

Supercomputer vs Progetti di calcolo distribuito

Le prestazioni del computer sono misurate in FLOPS (Floating Point Operations Per Second) , e nel giugno 2018,&nbsp Summit , un supercomputer costruito da IBM ora in funzione presso il Department of Energy (DOE) Oak Ridge National Laboratory (ORNL) del Dipartimento dell'Energia, ha catturato il posto numero uno per le più veloci prestazioni del computer a  122. 3 petaFLOPS sul LINPACK benchmark dove il peta è 1015. Rispetto ai PC domestici, il processore per PC domestici più veloce possibile ad un costo di 2.000 dollari fornisce circa 1 teraFLOPS dove tera è 1012.

Per i progetti di calcolo distribuito, vediamo Folding@home .

Il progetto utilizza le risorse di elaborazione risorse di elaborazione inattive di migliaia di personal computer di proprietà di volontari che hanno installato il software sui loro sistemi. Il suo scopo principale è quello di determinare i meccanismi di piegamento delle proteine, che è il processo attraverso il quale le proteine raggiungono la loro struttura tridimensionale finale, e di esaminare le cause del misfolding delle proteine. Questo è di notevole interesse accademico con importanti implicazioni per la ricerca medica e per il morbo di Alzheimer, il morbo di Huntington e molte forme di cancro, tra le altre malattie. In misura minore, Folding@home cerca anche di prevedere prevedere la struttura finale di una proteina e determinare come altre molecole possono interagire con essa, che ha applicazioni nella progettazione di farmaci. Folding@home è sviluppato e gestito dal Pande Laboratory at Stanford University

[…]

Dal suo lancio in ottobre 1, 2000, il Pande Lab ha prodotto 200 documenti di ricerca scientifica come risultato diretto di Folding@home vedi [https://foldingathome. org/papers-results]

Le statistiche fornite da Folding@home all'indirizzo https://stats.foldingathome.org/os dichiarano che il loro progetto fornisce una performance totale di 47.344 teraFLOPS nativi o 98.747 x86 teraFLOPS.

Si noti che questi valori di teraFLOPS provengono dai core del software, non dai valori di picco delle specifiche CPU/GPU e queste cifre hanno appena battuto le prestazioni del China’s Sunway TaihuLight nel 2016 che è stato classificato come il più veloce al mondo con 93 petaFLOPS sul benchmark LINPACK ora il 2° supercomputer più veloce ).

Costato

IBMs Summit Supercomputer è costato 200 milioni di dollari per costruire e secondo Wikipedia, il Sunway TaihuLight è costato 273 milioni di dollari. Se si considera che le prestazioni di calcolo fornite da Folding@home sono fornite da volontari (quindi il sistema è gratuito), non c'è da stupirsi che la potenza di calcolo offerta non venga disattesa.
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